炭疽病和蔓枯病是江西西瓜种植中危害最严重的两种真菌性病害，常在高温高湿季节爆发。炭疽病主要侵害叶片、茎蔓和果实。叶片受害初呈圆形水渍状黄斑，后转为褐色，边缘有黄色晕圈，潮湿时病斑上产生粉红色黏液；茎蔓受害出现椭圆形凹陷病斑，易折断；果实发病多在蒂部附近，产生圆形成凹陷斑，龟裂。蔓枯病则主要危害茎基部和中下部茎蔓，病部呈黄褐色，稍凹陷，表面散生黑色小点（分生孢子器），湿度大时溢出乳白色胶状物，严重时植株整片枯死，俗称“死藤病”。两者区别在于蔓枯病胶状物更多，且病斑处易碎裂。
病毒病被称为西瓜的“癌症”，在江西主要由蚜虫、粉虱传播。典型症状包括花叶、蕨叶、矮化、畸形瓜等。一旦发病，植株生长停滞，产量锐减。防治病毒病的关键在于切断传播媒介。首先要彻底清除田间及周边杂草，减少蚜虫寄主；其次，在苗期和生长期定期监测虫口密度，发现蚜虫立即喷施吡虫啉或噻虫嗪等杀虫剂。同时，避免在高温中午进行农事操作，防止病毒通过伤口传播。选用抗TY病毒病的砧木进行嫁接，也是目前最有效的预防手段之一。
预防胜于治疗。农业防治上，必须实行与非葫芦科作物3年以上轮作，选用抗病品种，加强田间排水，降低湿度。化学防治需遵循“早治、联防、轮换”原则。发现炭疽病初期，可选用苯醚甲环唑、咪鲜胺或吡唑醚菌酯喷雾；蔓枯病则需用咯菌腈、氟硅唑或戊唑醇进行茎基部喷淋，每7-10天一次，连用2-3次。特别注意，采收前15天停止用药，确保农药残留达标。雨季来临前，可提前喷施代森锰锌或多菌灵进行保护性预防，构建健康的田间微生态平衡。
