北京番茄早疫病多在5-6月高温高湿期暴发。叶片初现同心轮纹褐色斑，病斑湿度大时生黑霉。茎秆染病出现椭圆形病斑，果实蒂部形成黑褐色凹陷斑。防治方法：选用抗病品种；发病初期喷施75%百菌清600倍液或10%苯醚甲环唑1500倍液，每隔7天一次。北京地区可结合整枝时摘除病叶，减少菌源。
晚疫病是北京番茄的毁灭性病害，尤其是8月雨季。叶片从叶缘出现水渍状暗绿色斑，湿度大时病斑边缘产生白色霉层。果实上形成不规则褐色硬斑，茎秆变褐腐烂。防治关键：定植前用72.2%霜霉威盐酸盐800倍液蘸根；发病初期首选68%精甲霜·锰锌600倍液或50%烯酰吗啉1000倍液，配合嘧菌酯轮换使用。一旦发现中心病株，立即拔除并销毁。
灰霉病在北京大棚内冬春季危害重，主要侵染花和青果。花瓣先变褐腐烂，病部长出灰色霉层，果实脐部染病形成水渍状软腐。防治要点：定植前用50%腐霉利烟雾剂熏蒸；花期用50%异菌脲1000倍液喷花；发病初期喷施40%嘧霉胺悬浮剂800倍液，每7天一次。注意控制棚内湿度，上午先浇水，中午通风排湿。
番茄黄化曲叶病毒病在北京由烟粉虱传播。症状为上部叶片黄化、卷曲、变小，植株矮缩。防治必须切断传播途径：育苗期覆盖防虫网（40目）；定植前用10%吡虫啉1500倍液+1.8%阿维菌素3000倍液喷雾两次。发病初期喷施20%吗胍·乙酸铜500倍液，配合氨基酸叶面肥增强抗性。已感染植株需及时拔除深埋。
北京地区番茄病害防控应坚持“预防为主，综合防治”。冬季深翻晒土30天以上，亩施生石灰50公斤消毒；生长季每15天喷一次多功能生物菌剂（如枯草芽孢杆菌）提高植株抗病力。化学防治注意轮换用药，每次采收前7天停止用药。2026年推荐采用太阳能土壤消毒技术：7月高温期覆膜闷棚20天，可有效杀灭土传病菌。