新城疫是北京蛋鸡养殖头号威胁，死亡率高。症状：病鸡呼吸困难，发出咕咕声，嗉囊积液，排出绿色稀粪，出现扭头等神经症状。预防：7日龄用La Sota株疫苗点眼滴鼻，14日龄加强免疫；产蛋前用灭活苗注射。北京地区每年秋季全面补免一次。治疗：发病初期紧急接种4倍量疫苗，同时饮水添加多维和抗生素防止继发感染。病死鸡深埋或焚烧，严格隔离病鸡。
北京属于禽流感高风险区域，必须强制免疫。使用H5+H7三价灭活疫苗，雏鸡15日龄首免，30日龄二免，产蛋前再免一次。症状：鸡冠发紫，头部水肿，脚鳞出血，产蛋率骤降。一旦发现疑似病例，立即上报当地畜牧兽医部门，不得私自处理。日常防控：鸡舍安装防鸟网，禁止饲料车进场，养殖人员进出换衣消毒。北京地区冬季重点关注野鸟迁徙路线。
传染性法氏囊病主要侵害雏鸡，导致免疫抑制。症状：病鸡啄自己的泄殖腔，排出白色水样粪便。预防：14日龄用法氏囊弱毒疫苗饮水免疫。治疗：注射高免卵黄抗体，每只鸡0.5毫升。鸡白痢是细菌病，症状：雏鸡怕冷，糊肛，尖叫。预防：种鸡场做净化，雏鸡出壳后饮用0.05%恩诺沙星水三天。治疗：复方新诺明按0.2%拌料连用5天。北京地区种鸡场应每年做白痢检疫，淘汰阳性鸡。
球虫病多发于15-45日龄鸡，北京潮湿季节易发。症状：病鸡精神沉郁，排出带血粪便。预防：保持垫料干燥，网上平养可减少感染。使用球虫疫苗，1日龄喷雾或口服。治疗：地克珠利1毫克/公斤饲料浓度混饲，连用3-5天。注意轮换用药，防止耐药。夏季球虫高发，可在饲料中添加0.5%的氨丙啉预防。同时补充维生素K3，促进止血。
北京蛋鸡场必须实行全进全出制度，一批鸡出栏后空舍15天以上。进鸡前用火焰喷枪消毒地面，甲醛高锰酸钾熏蒸密闭48小时。每周带鸡消毒两次，交替使用百毒杀、聚维酮碘等消毒剂。死鸡和粪便做无害化处理，推荐使用堆肥发酵技术。养殖场门口设消毒池和紫外线灯，外来车辆和人员必须严格消毒。免疫程序要结合本场疫情史制定，优先使用联苗减少应激。