口蹄疫和小反刍兽疫是国家规定的一类动物疫病，危害极大，必须实施强制免疫。在山西地区，春秋两季是防疫的重点时段。养殖户应联系当地畜牧兽医站，购买正规厂家生产的疫苗。口蹄疫疫苗需每年免疫2-3次，接种部位通常为颈部肌肉注射，注意观察是否有过敏反应。小反刍兽疫疫苗主要接种6月龄以上的羊，一次免疫，终身有效（通常有效期为一年）。除了疫苗注射，还需做好耳标佩戴和档案记录，确保每只羊都有“身份证”，以便溯源。严禁使用未经批准或来源不明的疫苗，以免引发更大范围的疫情。
羊痘和布鲁氏菌病是另外两大威胁。羊痘多发于春秋季，症状为皮肤和黏膜出现丘疹、水疱、脓疱和结痂，伴有高烧。预防关键在于隔离病羊和全面消毒，发病后可使用抗病毒药物配合抗生素防止继发感染。布鲁氏菌病是人畜共患病，表现为母羊流产、公羊睾丸炎。该病一旦感染难以治愈，因此预防至关重要。引种时必须严格检疫，确诊阳性羊只应立即扑杀并无害化处理。日常饲养中，要保持圈舍干燥卫生，避免野鸟、鼠类接触饲料和水源，切断传播途径。
体内寄生虫如肝片吸虫、捻转血矛线虫，体外寄生虫如疥螨、蜱虫，会严重削弱羊只体质，导致消瘦、贫血甚至死亡。山西地区潮湿季节易滋生蚊虫蜱虫，应定期使用敌百虫溶液喷洒羊体和圈舍墙壁。体内驱虫建议每季度进行一次，常用药物包括阿苯达唑、伊维菌素和左旋咪唑。不同种类寄生虫需用不同特效药，必要时做粪检确定虫种。驱虫后要及时清理粪便，集中发酵处理，杀灭虫卵。对于疥螨病，可采用伊维菌素皮下注射配合局部涂药的方式治疗，连续两次，间隔一周，确保根治。
建立严格的生物安全制度是最后的防线。进出场人员、车辆必须经过彻底消毒。场门口设置消毒池，内部道路定期撒生石灰。发现疑似传染病病例，首先要立即封锁现场，禁止羊只移动，并向当地动物卫生监督机构报告。在专业人员指导下进行采样检测。确诊后，按照《动物防疫法》规定，对污染区域进行终末消毒，对同群羊进行紧急免疫或隔离观察。同时，做好病死羊的无害化处理，严禁随意丢弃或食用，防止病原扩散和食品安全事故。通过构建“免疫-驱虫-消毒-监测”四位一体的防控体系，最大程度保障肉羊养殖安全。
